Fat Ninja – це гра про ніндзя, що базується на прихованості. Використовуючи свої навички ніндзя, намагайтеся не потрапити на очі охоронцям, пробираючись будівлею. Вирішуйте самі, чи варто вам ховатися, чи використовувати один зі своїх атакуючих прийомів, щоб убити охоронців. Ви можете ховатися за предметами або застрибувати й триматися за стелю. Ви можете атакувати своїм мечем або використовуючи свою таємну зброю – свої ПУКИ. Щоразу, коли вас помічають, шкала тривоги зростатиме, і якщо вона досягне кінця – гра закінчена.